计算咨询委员会

阿图尔巴特

阿图尔巴特MD博士是系统医学部主任和儿科副教授,医药,出于礼貌,计算机科学,斯坦福大学和露西尔·帕卡德儿童医院。博士。在布朗大学接受过计算机科学培训,曾在苹果和微软担任软件工程师,在布朗大学获得博士学位,在波士顿儿童医院接受过儿科和儿科内分泌学培训,随后,他获得了哈佛医学院和麻省理工学院(MIT)的健康科学和技术博士学位。

斯坦福大学的巴特实验室建立并应用了转换超过3000亿个分子点的工具,临床,以及研究人员和临床医生在过去十年中对诊断的流行病学数据,治疗学,以及对疾病的新见解。巴特实验室目前由霍华德休斯医学院(HHMI)和15个国家卫生研究院(NIH)资助。巴特实验室已经开发出生物信息学方法来获取基因组,遗传的,以及来自多个来源和疾病的表型数据以及这些数据的原因,以创建新的诊断方法,治疗学,发现新的疾病分子机制。这种方法的例子包括发表在《国家科学院院院刊》(2000年)上的关于癌症药物发现的工作。《国家科学院学报》(2003年)上发表的关于2型糖尿病的研究,关于脂肪细胞的形成发表在《自然细胞生物学》(2005年)上,关于生物信息学中的肥胖问题(2007年),以及发表在《国家科学院学报》(2009年)上的移植。为了促进这一点,Butte实验室已经开发了工具,根据每个实验的表型和上下文细节自动索引和查找基因组数据集。发表于《自然生物技术》(2006年),重新映射微阵列数据,发表于《自然方法》(2007年)。为了消除多细胞样本的团聚,发表于《自然方法》(2010年)。巴特实验室还在开发新的方法,将电子健康记录系统的临床数据与基因表达数据进行比较。如科学(2008)所述,他是第一个对病人进行全基因组临床注释的小组成员,如《柳叶刀》(2010)所述。该实验室目前由卫生和健康管理局资助,并获得了16项国家卫生研究院拨款。

博士。Butte撰写了100多篇出版物,并在个性化和系统医学领域发表了120多篇受邀演讲,生物医学信息学,分子糖尿病,包括NIH或NIH相关会议上的20人。博士。巴特的研究已经在《纽约时报》和《国际先驱论坛报》(2008年)上发表。《华尔街日报》(2010年和2011年)和圣何塞水星新闻(2010年)。博士。巴特最近获得的奖项包括2010年儿科研究学会青年研究员奖,2009年进入美国医学信息学学院,2008年AMIA新研究员奖,2007年基因组技术“明日首席研究员”奖,2007年医学决策学会杰出短科奖,2006年霍华德休斯医学院早期职业奖,信息学研究的2006个PROMA基金会以及2002年和2003年美国临床化学协会杰出演讲人奖。博士。巴特还与麻省理工出版社合著了第一本关于微阵列分析的书,书名为《整合基因组的微阵列》。

大卫·豪斯勒

大卫·豪斯勒的研究在于数学的接口,计算机科学,分子生物学。他开发了新的统计和算法方法来探索人类基因组的分子功能和进化,整合跨物种比较和高通量基因组学数据研究基因结构,函数,和监管。他开创了隐马尔可夫模型(HMMS)的应用,随机上下文无关文法,以及分析DNA的鉴别核方法,RNA和蛋白质序列。他是第一个将后一种方法应用于全基因组搜索癌症基因表达生物标志物的人,现在是他实验室的一项重大工作。

作为国际人类基因组计划的合作者,他的团队于7月7日在互联网上发布了第一个公开的人类基因组序列计算汇编。2000。在此之后,他的团队开发了加利福尼亚大学,圣克鲁斯(UCSC)基因组浏览器,一种基于网络的工具,广泛用于生物医学研究,并作为几个大规模基因组学项目的平台,包括国家人类基因组研究所(NHGRI)的编码项目,该项目使用OMIC方法探索人类基因组中每个基础的功能(UCSC作为数据协调中心)。NIH的哺乳动物基因收集,NHGRI研究人类遗传变异的1000个基因组计划,国家癌症研究所(NCIS)癌症基因组图谱项目旨在探索癌症的基因组变化。

他的小组的信息学研究癌症基因组学,包括UCSC癌症基因组浏览器,提供完整的分析管道,从原始DNA读取,通过检测和解释突变和改变基因表达的肿瘤样本。他的团队与全国医疗中心的研究人员合作,包括癌症“梦之队”和癌症基因组图谱的成员,发现癌症的分子成因,开创个性化的新局面,基于基因组学的癌症治疗方法。William Hill彩票他共同发起了一个基因组10千项目,组装了一个基因组动物园——一个代表10000种脊椎动物基因组的DNA序列集合,以捕捉遗传多样性,作为生命科学和全球保护工作的资源。

豪斯勒在博尔德的科罗拉多大学获得了计算机科学博士学位。他是美国国家科学院和美国艺术与科学院的成员,也是人工智能促进学会和协会(AAAI)的成员。他曾多次获奖,包括2011年牛津大学韦尔登纪念奖,2009年Ashg Curt Stern人类遗传学奖,2008年国际计算生物学学会高级科学家成就奖,卡内基梅隆大学2005年迪克森科学奖,以及2003年ACM/AAAIAllenNewell人工智能奖。

科勒

达芙妮·科勒是斯坦福大学计算机科学系的拉杰夫·莫特瓦尼教授。她的主要研究兴趣是开发和使用机器学习和概率方法来建模和分析复杂领域。她目前的研究项目包括计算生物学模型,计算医学,从物理世界的传感器数据中提取语义意义。达芙妮·科勒是180多篇参考出版物的作者,出现在各个科学场馆,科学转化医学,自然遗传学,细胞,游戏和经济行为,以及各种人工智能和计算机科学的会议和期刊。她曾获得9项最佳论文或最佳学生论文奖,并在10多个主要会议上发表主题演讲。也跨越了不同的领域。她是2007年NIPS和2001年UAI会议的项目联合主席,曾在多个项目委员会和《人工智能研究杂志》副主编任职,机器学习杂志,以及机器学习研究杂志。她于1994年获得亚瑟·塞缪尔论文奖,1996斯隆基金会奖学金1998年ONR青年调查员奖,1999年的总统科学家和工程师早期职业奖,2001年ijcai计算机与思想奖,2003年在斯坦福大学培养本科生研究的考克斯优秀奖,麦克阿瑟基金会成立于2004,2008年ACM/Infosys奖,2011年进入国家工程院。

吉尔梅西洛夫

Jill Mesirov是布罗德研究所的副主任兼首席信息官,她指导计算生物学和生物信息学。布罗德的计算生物学和生物信息学界包括计算科学家,软件工程师,以及在整个研究所的项目和平台中工作的信息技术专家。他们在广泛的生物和技术应用中分享他们的专业知识。梅西罗夫也是大卫H的成员。麻省理工学院科赫癌症综合研究所和波士顿大学生物信息学副教授。

Mesirov是一名计算科学家,多年来一直致力于高性能计算领域,研究科学中出现的问题,工程,和业务应用程序。她目前的研究兴趣是计算生物学,专注于模式识别和发现的算法和分析方法,以及在癌症基因组学和传染病中的应用。此外,Mesirov致力于实践的发展,可访问的软件工具,将这些方法带到一般生物医学研究社区。

1997,梅西罗夫来到怀特黑德研究所/麻省理工学院基因组研究中心,现在是布罗德学院的一员,来自IBM,她是医疗/制药解决方案组织的计算生物学和生物信息学经理。在1995年加入IBM之前,她在Thinking Machines Corporation担任研究主管10年。她还曾在加州大学伯克利分校数学系任职,并担任美国数学学会副执行主任。

Mesirov是美国科学进步协会的会员,国际计算生物学学会主任,前数学妇女协会主席。她在众多学术和企业科学咨询和期刊编辑委员会任职。

梅西罗夫从宾夕法尼亚大学获得数学学士学位。她在布兰代斯大学获得数学硕士和博士学位。

约翰·奎肯·布什,博士学位

John Quackenbush于1990年获得加州大学理论物理博士学位,洛杉矶大学正在研究弦理论模型。在担任物理博士后2年后,博士。Quackenbush申请并获得了国家人类基因组研究中心的特别重点研究职业奖,负责人类基因组项目。他在索尔克研究所工作了2年,研究人类11号染色体的物理图谱,在斯坦福大学工作了2年,研究人类基因组测序的新实验室和计算策略。1997,他加入了基因组研究所(TIGR)的教员,他的重点开始转向后基因组应用,重点是微阵列分析。结合实验室和计算方法,博士。Quackenbush和他的团队开发了基于跨领域数据集成的分析方法,从高维数据中学习生物学意义。2005,他被任命为达纳法伯癌症研究所(DFCI)的生物统计学和计算生物学教授和癌症生物学教授,以及哈佛公共卫生学院的计算生物学和生物信息学教授。从那时起,他的工作越来越多地集中在使用基于系统的方法来理解和建模生物学问题的人类癌症分析上。2010,他在DFCI成立了癌症计算生物学中心(CCCB)。利用合作咨询模式,为当地研究界提供广泛的生物信息学支持,以及进行和分析大规模的第二代DNA测序。

他的专长是基因组技术,包括序列和基于阵列的方法,整合基因组学,个性化基因组学,以及整合临床和研究数据来推动发现。